एनआईईआर: ऑटोमेटा की कहानी तीन अलग-अलग नाटकों में सामने आती है। जबकि पहले दो प्लेथ्रूज़ काफी ओवरलैप साझा करते हैं, तीसरा प्लेथ्रू प्रारंभिक क्रेडिट से परे अतिरिक्त कहानी सामग्री का खजाना दिखाता है।
हालाँकि गेम में तीन मुख्य प्लेथ्रू होते हैं जो कई अंत की ओर ले जाते हैं, कुछ अंत के लिए विशिष्ट चरित्र प्लेथ्रू और क्रियाओं की आवश्यकता होती है। यह मार्गदर्शिका तीन बजाने योग्य पात्रों और उनके बीच स्विच करने की प्रक्रिया का विवरण देती है।
NieR: ऑटोमेटा के मुख्य पात्र 2B, 9S और A2 हैं। 2बी और 9एस, कहानी में भागीदार, प्लेथ्रू के आधार पर महत्वपूर्ण स्क्रीन समय का आदेश देते हैं। प्रत्येक चरित्र एक अनूठी लड़ाई शैली का दावा करता है, जो सुसंगत प्लग-इन चिप्स के साथ भी गेमप्ले में गहराई जोड़ता है। तीनों बजाने योग्य हैं, लेकिन चरित्र परिवर्तन हमेशा तत्काल नहीं होता है।
प्रारंभिक नाटक के दौरान चरित्र चयन तय होता है:
मुख्य अंत को पूरा करने से अध्याय चयन मोड अनलॉक हो जाता है, जिससे चरित्र चयन की अनुमति मिलती है। अध्याय चयन 17 अध्यायों में से किसी एक को दोबारा देखने में सक्षम बनाता है। स्क्रीन के दाईं ओर प्रदर्शित संख्याएँ प्रत्येक वर्ण के लिए पूर्ण/अपूर्ण पार्श्व खोजों को दर्शाती हैं। यदि कोई वर्ण किसी अध्याय के लिए संख्याएँ दिखाता है, तो उस अध्याय को उस वर्ण के रूप में दोबारा चलाया जा सकता है।
ध्यान दें कि बाद के अध्याय, विशेष रूप से प्लेथ्रू 3 में, चरित्र चयन को प्रतिबंधित करते हैं। जबकि अध्याय चयन चरित्र परिवर्तन की अनुमति देता है, आपको कहानी के उन बिंदुओं पर नेविगेट करना होगा जहां वह चरित्र मूल रूप से खेलने योग्य था। अध्याय बदलने से पहले सहेजना सुनिश्चित करता है कि प्रगति जारी रहे, जिससे तीनों वर्णों के लिए साझा स्तर की प्रगति हो सके।